Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFT2D1Q8WV19 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SFT2D1Q8WV19 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFT2D1Q8WV19 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SFT2D1Q8WV19 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms