Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC197Q8NCU1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC197Q8NCU1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC197Q8NCU1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC197Q8NCU1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC197Q8NCU1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC197Q8NCU1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC197Q8NCU1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC197Q8NCU1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC197Q8NCU1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC197Q8NCU1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC197Q8NCU1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC197Q8NCU1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC197Q8NCU1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC197Q8NCU1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC197Q8NCU1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC197Q8NCU1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC197Q8NCU1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC197Q8NCU1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC197Q8NCU1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC197Q8NCU1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC197Q8NCU1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC197Q8NCU1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC197Q8NCU1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC197Q8NCU1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC197Q8NCU1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC197Q8NCU1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC197Q8NCU1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC197Q8NCU1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC197Q8NCU1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC197Q8NCU1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC197Q8NCU1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC197Q8NCU1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC197Q8NCU1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC197Q8NCU1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC197Q8NCU1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC197Q8NCU1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC197Q8NCU1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC197Q8NCU1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC197Q8NCU1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC197Q8NCU1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC197Q8NCU1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC197Q8NCU1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC197Q8NCU1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC197Q8NCU1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC197Q8NCU1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC197Q8NCU1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC197Q8NCU1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms