Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO39Q8N4B4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO39Q8N4B4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO39Q8N4B4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO39Q8N4B4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO39Q8N4B4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO39Q8N4B4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO39Q8N4B4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO39Q8N4B4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO39Q8N4B4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO39Q8N4B4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO39Q8N4B4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO39Q8N4B4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO39Q8N4B4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO39Q8N4B4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO39Q8N4B4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO39Q8N4B4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FBXO39Q8N4B4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FBXO39Q8N4B4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO39Q8N4B4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO39Q8N4B4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO39Q8N4B4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FBXO39Q8N4B4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO39Q8N4B4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms