Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLGN4XQ8N0W4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NLGN4XQ8N0W4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLGN4XQ8N0W4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLGN4XQ8N0W4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLGN4XQ8N0W4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NLGN4XQ8N0W4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLGN4XQ8N0W4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NLGN4XQ8N0W4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NLGN4XQ8N0W4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLGN4XQ8N0W4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLGN4XQ8N0W4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLGN4XQ8N0W4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLGN4XQ8N0W4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLGN4XQ8N0W4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLGN4XQ8N0W4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NLGN4XQ8N0W4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLGN4XQ8N0W4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NLGN4XQ8N0W4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NLGN4XQ8N0W4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NLGN4XQ8N0W4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NLGN4XQ8N0W4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NLGN4XQ8N0W4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLGN4XQ8N0W4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NLGN4XQ8N0W4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NLGN4XQ8N0W4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLGN4XQ8N0W4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLGN4XQ8N0W4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NLGN4XQ8N0W4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NLGN4XQ8N0W4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NLGN4XQ8N0W4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN4XQ8N0W4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN4XQ8N0W4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms