Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF13Q86YI8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF13Q86YI8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF13Q86YI8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF13Q86YI8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF13Q86YI8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF13Q86YI8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHF13Q86YI8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHF13Q86YI8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHF13Q86YI8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHF13Q86YI8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHF13Q86YI8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHF13Q86YI8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHF13Q86YI8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHF13Q86YI8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHF13Q86YI8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHF13Q86YI8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHF13Q86YI8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHF13Q86YI8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHF13Q86YI8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHF13Q86YI8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHF13Q86YI8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHF13Q86YI8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHF13Q86YI8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PHF13Q86YI8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHF13Q86YI8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF13Q86YI8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF13Q86YI8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF13Q86YI8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF13Q86YI8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF13Q86YI8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHF13Q86YI8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PHF13Q86YI8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHF13Q86YI8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHF13Q86YI8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHF13Q86YI8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHF13Q86YI8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHF13Q86YI8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF13Q86YI8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF13Q86YI8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHF13Q86YI8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHF13Q86YI8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHF13Q86YI8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHF13Q86YI8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHF13Q86YI8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF13Q86YI8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF13Q86YI8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF13Q86YI8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHF13Q86YI8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHF13Q86YI8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHF13Q86YI8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHF13Q86YI8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHF13Q86YI8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHF13Q86YI8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHF13Q86YI8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHF13Q86YI8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHF13Q86YI8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHF13Q86YI8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF13Q86YI8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF13Q86YI8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF13Q86YI8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF13Q86YI8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF13Q86YI8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF13Q86YI8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF13Q86YI8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF13Q86YI8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHF13Q86YI8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PHF13Q86YI8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PHF13Q86YI8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHF13Q86YI8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHF13Q86YI8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHF13Q86YI8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHF13Q86YI8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHF13Q86YI8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms