Protein–RNA interactions for Protein: Q71DI3

HIST2H3A, Histone H3.2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H3AQ71DI3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HIST2H3AQ71DI3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIST2H3AQ71DI3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIST2H3AQ71DI3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST2H3AQ71DI3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST2H3AQ71DI3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST2H3AQ71DI3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST2H3AQ71DI3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST2H3AQ71DI3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST2H3AQ71DI3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIST2H3AQ71DI3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIST2H3AQ71DI3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HIST2H3AQ71DI3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIST2H3AQ71DI3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIST2H3AQ71DI3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIST2H3AQ71DI3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIST2H3AQ71DI3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST2H3AQ71DI3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIST2H3AQ71DI3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST2H3AQ71DI3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST2H3AQ71DI3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST2H3AQ71DI3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST2H3AQ71DI3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST2H3AQ71DI3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HIST2H3AQ71DI3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIST2H3AQ71DI3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST2H3AQ71DI3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST2H3AQ71DI3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST2H3AQ71DI3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST2H3AQ71DI3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST2H3AQ71DI3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST2H3AQ71DI3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST2H3AQ71DI3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIST2H3AQ71DI3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST2H3AQ71DI3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST2H3AQ71DI3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIST2H3AQ71DI3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST2H3AQ71DI3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST2H3AQ71DI3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIST2H3AQ71DI3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST2H3AQ71DI3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIST2H3AQ71DI3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms