Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWN0

LYPD4, Ly6/PLAUR domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD4Q6UWN0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LYPD4Q6UWN0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYPD4Q6UWN0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYPD4Q6UWN0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYPD4Q6UWN0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYPD4Q6UWN0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYPD4Q6UWN0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYPD4Q6UWN0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYPD4Q6UWN0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYPD4Q6UWN0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYPD4Q6UWN0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYPD4Q6UWN0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYPD4Q6UWN0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LYPD4Q6UWN0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LYPD4Q6UWN0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LYPD4Q6UWN0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LYPD4Q6UWN0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYPD4Q6UWN0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYPD4Q6UWN0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYPD4Q6UWN0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LYPD4Q6UWN0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYPD4Q6UWN0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYPD4Q6UWN0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYPD4Q6UWN0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYPD4Q6UWN0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYPD4Q6UWN0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYPD4Q6UWN0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYPD4Q6UWN0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYPD4Q6UWN0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYPD4Q6UWN0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LYPD4Q6UWN0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYPD4Q6UWN0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYPD4Q6UWN0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYPD4Q6UWN0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYPD4Q6UWN0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYPD4Q6UWN0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYPD4Q6UWN0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYPD4Q6UWN0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYPD4Q6UWN0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYPD4Q6UWN0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYPD4Q6UWN0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYPD4Q6UWN0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYPD4Q6UWN0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYPD4Q6UWN0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYPD4Q6UWN0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYPD4Q6UWN0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYPD4Q6UWN0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYPD4Q6UWN0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYPD4Q6UWN0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYPD4Q6UWN0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYPD4Q6UWN0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYPD4Q6UWN0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYPD4Q6UWN0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYPD4Q6UWN0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYPD4Q6UWN0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYPD4Q6UWN0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYPD4Q6UWN0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYPD4Q6UWN0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYPD4Q6UWN0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYPD4Q6UWN0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LYPD4Q6UWN0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LYPD4Q6UWN0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms