Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCD3Q6STE5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMARCD3Q6STE5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMARCD3Q6STE5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms