Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSSK4Q6SA08 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSSK4Q6SA08 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSSK4Q6SA08 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSSK4Q6SA08 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSSK4Q6SA08 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSSK4Q6SA08 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSSK4Q6SA08 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSSK4Q6SA08 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSSK4Q6SA08 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TSSK4Q6SA08 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSSK4Q6SA08 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSSK4Q6SA08 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSSK4Q6SA08 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TSSK4Q6SA08 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSSK4Q6SA08 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSSK4Q6SA08 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSSK4Q6SA08 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSSK4Q6SA08 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSSK4Q6SA08 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSSK4Q6SA08 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSSK4Q6SA08 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSSK4Q6SA08 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TSSK4Q6SA08 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TSSK4Q6SA08 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSSK4Q6SA08 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSSK4Q6SA08 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSSK4Q6SA08 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSSK4Q6SA08 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSSK4Q6SA08 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSSK4Q6SA08 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSSK4Q6SA08 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSSK4Q6SA08 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSSK4Q6SA08 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSSK4Q6SA08 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSSK4Q6SA08 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSSK4Q6SA08 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSSK4Q6SA08 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TSSK4Q6SA08 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSSK4Q6SA08 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSSK4Q6SA08 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSSK4Q6SA08 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSSK4Q6SA08 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSSK4Q6SA08 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSSK4Q6SA08 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSSK4Q6SA08 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSSK4Q6SA08 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TSSK4Q6SA08 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TSSK4Q6SA08 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSSK4Q6SA08 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSSK4Q6SA08 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSSK4Q6SA08 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSSK4Q6SA08 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSSK4Q6SA08 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSSK4Q6SA08 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSSK4Q6SA08 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSSK4Q6SA08 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSSK4Q6SA08 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSSK4Q6SA08 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSSK4Q6SA08 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TSSK4Q6SA08 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSSK4Q6SA08 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSSK4Q6SA08 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TSSK4Q6SA08 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSSK4Q6SA08 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSSK4Q6SA08 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSSK4Q6SA08 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSSK4Q6SA08 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSSK4Q6SA08 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSSK4Q6SA08 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TSSK4Q6SA08 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSSK4Q6SA08 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSSK4Q6SA08 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TSSK4Q6SA08 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSSK4Q6SA08 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSSK4Q6SA08 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSSK4Q6SA08 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSSK4Q6SA08 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSSK4Q6SA08 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSSK4Q6SA08 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TSSK4Q6SA08 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSSK4Q6SA08 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TSSK4Q6SA08 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSSK4Q6SA08 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSSK4Q6SA08 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSSK4Q6SA08 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSSK4Q6SA08 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TSSK4Q6SA08 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSSK4Q6SA08 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TSSK4Q6SA08 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSSK4Q6SA08 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSSK4Q6SA08 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSSK4Q6SA08 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSSK4Q6SA08 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSSK4Q6SA08 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSSK4Q6SA08 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSSK4Q6SA08 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSSK4Q6SA08 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TSSK4Q6SA08 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSSK4Q6SA08 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms