Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED27Q6P2C8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED27Q6P2C8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED27Q6P2C8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MED27Q6P2C8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MED27Q6P2C8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED27Q6P2C8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED27Q6P2C8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED27Q6P2C8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED27Q6P2C8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MED27Q6P2C8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED27Q6P2C8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED27Q6P2C8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MED27Q6P2C8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED27Q6P2C8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MED27Q6P2C8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED27Q6P2C8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MED27Q6P2C8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED27Q6P2C8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED27Q6P2C8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED27Q6P2C8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MED27Q6P2C8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED27Q6P2C8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MED27Q6P2C8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED27Q6P2C8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MED27Q6P2C8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MED27Q6P2C8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED27Q6P2C8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED27Q6P2C8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED27Q6P2C8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED27Q6P2C8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED27Q6P2C8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED27Q6P2C8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED27Q6P2C8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED27Q6P2C8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED27Q6P2C8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED27Q6P2C8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED27Q6P2C8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED27Q6P2C8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED27Q6P2C8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED27Q6P2C8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED27Q6P2C8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED27Q6P2C8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED27Q6P2C8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED27Q6P2C8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MED27Q6P2C8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms