Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf140Q5VVS0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf140Q5VVS0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1orf140Q5VVS0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf140Q5VVS0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf140Q5VVS0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf140Q5VVS0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf140Q5VVS0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf140Q5VVS0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C1orf140Q5VVS0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf140Q5VVS0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf140Q5VVS0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1orf140Q5VVS0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf140Q5VVS0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf140Q5VVS0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1orf140Q5VVS0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf140Q5VVS0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf140Q5VVS0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf140Q5VVS0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf140Q5VVS0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf140Q5VVS0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1orf140Q5VVS0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf140Q5VVS0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1orf140Q5VVS0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf140Q5VVS0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C1orf140Q5VVS0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf140Q5VVS0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf140Q5VVS0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf140Q5VVS0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf140Q5VVS0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf140Q5VVS0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf140Q5VVS0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf140Q5VVS0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf140Q5VVS0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf140Q5VVS0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms