Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CACHD1Q5VU97 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACHD1Q5VU97 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACHD1Q5VU97 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACHD1Q5VU97 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACHD1Q5VU97 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACHD1Q5VU97 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACHD1Q5VU97 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACHD1Q5VU97 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACHD1Q5VU97 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACHD1Q5VU97 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CACHD1Q5VU97 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACHD1Q5VU97 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACHD1Q5VU97 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACHD1Q5VU97 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACHD1Q5VU97 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACHD1Q5VU97 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACHD1Q5VU97 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACHD1Q5VU97 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACHD1Q5VU97 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACHD1Q5VU97 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACHD1Q5VU97 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACHD1Q5VU97 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACHD1Q5VU97 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACHD1Q5VU97 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACHD1Q5VU97 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACHD1Q5VU97 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACHD1Q5VU97 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACHD1Q5VU97 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACHD1Q5VU97 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACHD1Q5VU97 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACHD1Q5VU97 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACHD1Q5VU97 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACHD1Q5VU97 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACHD1Q5VU97 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACHD1Q5VU97 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACHD1Q5VU97 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACHD1Q5VU97 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACHD1Q5VU97 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACHD1Q5VU97 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACHD1Q5VU97 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACHD1Q5VU97 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACHD1Q5VU97 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACHD1Q5VU97 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACHD1Q5VU97 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACHD1Q5VU97 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACHD1Q5VU97 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACHD1Q5VU97 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACHD1Q5VU97 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACHD1Q5VU97 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACHD1Q5VU97 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACHD1Q5VU97 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACHD1Q5VU97 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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