Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC01545Q5VT33 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC01545Q5VT33 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01545Q5VT33 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01545Q5VT33 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms