Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZB4

C9orf50, Uncharacterized protein C9orf50, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf50Q5SZB4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C9orf50Q5SZB4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf50Q5SZB4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf50Q5SZB4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C9orf50Q5SZB4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf50Q5SZB4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf50Q5SZB4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf50Q5SZB4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C9orf50Q5SZB4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf50Q5SZB4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf50Q5SZB4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf50Q5SZB4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf50Q5SZB4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf50Q5SZB4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf50Q5SZB4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C9orf50Q5SZB4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf50Q5SZB4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf50Q5SZB4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf50Q5SZB4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
C9orf50Q5SZB4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C9orf50Q5SZB4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf50Q5SZB4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf50Q5SZB4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C9orf50Q5SZB4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C9orf50Q5SZB4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf50Q5SZB4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf50Q5SZB4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf50Q5SZB4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf50Q5SZB4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf50Q5SZB4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf50Q5SZB4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
C9orf50Q5SZB4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C9orf50Q5SZB4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf50Q5SZB4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf50Q5SZB4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf50Q5SZB4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C9orf50Q5SZB4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C9orf50Q5SZB4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf50Q5SZB4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf50Q5SZB4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf50Q5SZB4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C9orf50Q5SZB4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf50Q5SZB4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf50Q5SZB4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf50Q5SZB4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf50Q5SZB4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf50Q5SZB4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf50Q5SZB4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf50Q5SZB4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf50Q5SZB4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf50Q5SZB4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf50Q5SZB4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf50Q5SZB4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf50Q5SZB4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf50Q5SZB4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
C9orf50Q5SZB4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf50Q5SZB4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
C9orf50Q5SZB4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
C9orf50Q5SZB4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9orf50Q5SZB4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C9orf50Q5SZB4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
C9orf50Q5SZB4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf50Q5SZB4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf50Q5SZB4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf50Q5SZB4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C9orf50Q5SZB4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf50Q5SZB4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C9orf50Q5SZB4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C9orf50Q5SZB4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C9orf50Q5SZB4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf50Q5SZB4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C9orf50Q5SZB4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf50Q5SZB4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf50Q5SZB4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
C9orf50Q5SZB4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf50Q5SZB4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf50Q5SZB4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
C9orf50Q5SZB4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C9orf50Q5SZB4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
C9orf50Q5SZB4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
C9orf50Q5SZB4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C9orf50Q5SZB4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C9orf50Q5SZB4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C9orf50Q5SZB4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C9orf50Q5SZB4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
C9orf50Q5SZB4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C9orf50Q5SZB4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C9orf50Q5SZB4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C9orf50Q5SZB4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C9orf50Q5SZB4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C9orf50Q5SZB4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C9orf50Q5SZB4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C9orf50Q5SZB4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
C9orf50Q5SZB4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C9orf50Q5SZB4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C9orf50Q5SZB4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C9orf50Q5SZB4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C9orf50Q5SZB4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C9orf50Q5SZB4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C9orf50Q5SZB4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms