Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KHDC3LQ587J8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KHDC3LQ587J8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KHDC3LQ587J8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KHDC3LQ587J8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KHDC3LQ587J8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KHDC3LQ587J8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KHDC3LQ587J8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KHDC3LQ587J8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KHDC3LQ587J8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KHDC3LQ587J8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KHDC3LQ587J8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KHDC3LQ587J8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KHDC3LQ587J8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KHDC3LQ587J8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KHDC3LQ587J8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KHDC3LQ587J8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KHDC3LQ587J8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KHDC3LQ587J8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KHDC3LQ587J8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KHDC3LQ587J8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KHDC3LQ587J8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KHDC3LQ587J8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KHDC3LQ587J8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KHDC3LQ587J8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
KHDC3LQ587J8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KHDC3LQ587J8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
KHDC3LQ587J8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
KHDC3LQ587J8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
KHDC3LQ587J8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KHDC3LQ587J8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KHDC3LQ587J8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KHDC3LQ587J8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KHDC3LQ587J8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KHDC3LQ587J8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KHDC3LQ587J8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KHDC3LQ587J8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KHDC3LQ587J8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KHDC3LQ587J8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KHDC3LQ587J8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KHDC3LQ587J8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KHDC3LQ587J8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KHDC3LQ587J8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KHDC3LQ587J8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KHDC3LQ587J8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KHDC3LQ587J8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms