Protein–RNA interactions for Protein: Q56P42

PYDC2, Pyrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC2Q56P42 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PYDC2Q56P42 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PYDC2Q56P42 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PYDC2Q56P42 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PYDC2Q56P42 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PYDC2Q56P42 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PYDC2Q56P42 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PYDC2Q56P42 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PYDC2Q56P42 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PYDC2Q56P42 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PYDC2Q56P42 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PYDC2Q56P42 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PYDC2Q56P42 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PYDC2Q56P42 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PYDC2Q56P42 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PYDC2Q56P42 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PYDC2Q56P42 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PYDC2Q56P42 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PYDC2Q56P42 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYDC2Q56P42 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYDC2Q56P42 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PYDC2Q56P42 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PYDC2Q56P42 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PYDC2Q56P42 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PYDC2Q56P42 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PYDC2Q56P42 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PYDC2Q56P42 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PYDC2Q56P42 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYDC2Q56P42 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYDC2Q56P42 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYDC2Q56P42 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PYDC2Q56P42 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYDC2Q56P42 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYDC2Q56P42 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PYDC2Q56P42 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms