Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPAT3Q53EU6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPAT3Q53EU6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPAT3Q53EU6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GPAT3Q53EU6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPAT3Q53EU6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPAT3Q53EU6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPAT3Q53EU6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPAT3Q53EU6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPAT3Q53EU6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GPAT3Q53EU6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPAT3Q53EU6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPAT3Q53EU6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPAT3Q53EU6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPAT3Q53EU6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GPAT3Q53EU6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GPAT3Q53EU6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPAT3Q53EU6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPAT3Q53EU6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPAT3Q53EU6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms