Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC31

CCDC58, Coiled-coil domain-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC58Q4VC31 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC58Q4VC31 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC58Q4VC31 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC58Q4VC31 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC58Q4VC31 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC58Q4VC31 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC58Q4VC31 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC58Q4VC31 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC58Q4VC31 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC58Q4VC31 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC58Q4VC31 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC58Q4VC31 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC58Q4VC31 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC58Q4VC31 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC58Q4VC31 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC58Q4VC31 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC58Q4VC31 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC58Q4VC31 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC58Q4VC31 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC58Q4VC31 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC58Q4VC31 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC58Q4VC31 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC58Q4VC31 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC58Q4VC31 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC58Q4VC31 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC58Q4VC31 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC58Q4VC31 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC58Q4VC31 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC58Q4VC31 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC58Q4VC31 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC58Q4VC31 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC58Q4VC31 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC58Q4VC31 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC58Q4VC31 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC58Q4VC31 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC58Q4VC31 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC58Q4VC31 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC58Q4VC31 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC58Q4VC31 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC58Q4VC31 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC58Q4VC31 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC58Q4VC31 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC58Q4VC31 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC58Q4VC31 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC58Q4VC31 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC58Q4VC31 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC58Q4VC31 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC58Q4VC31 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC58Q4VC31 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC58Q4VC31 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC58Q4VC31 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC58Q4VC31 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC58Q4VC31 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms