Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TYSND1Q2T9J0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TYSND1Q2T9J0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TYSND1Q2T9J0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TYSND1Q2T9J0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TYSND1Q2T9J0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TYSND1Q2T9J0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TYSND1Q2T9J0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TYSND1Q2T9J0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TYSND1Q2T9J0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TYSND1Q2T9J0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TYSND1Q2T9J0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TYSND1Q2T9J0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TYSND1Q2T9J0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TYSND1Q2T9J0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TYSND1Q2T9J0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TYSND1Q2T9J0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TYSND1Q2T9J0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TYSND1Q2T9J0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TYSND1Q2T9J0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TYSND1Q2T9J0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TYSND1Q2T9J0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TYSND1Q2T9J0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TYSND1Q2T9J0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TYSND1Q2T9J0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TYSND1Q2T9J0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TYSND1Q2T9J0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TYSND1Q2T9J0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TYSND1Q2T9J0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TYSND1Q2T9J0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TYSND1Q2T9J0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TYSND1Q2T9J0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TYSND1Q2T9J0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TYSND1Q2T9J0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TYSND1Q2T9J0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TYSND1Q2T9J0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TYSND1Q2T9J0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TYSND1Q2T9J0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TYSND1Q2T9J0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TYSND1Q2T9J0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TYSND1Q2T9J0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TYSND1Q2T9J0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TYSND1Q2T9J0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TYSND1Q2T9J0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TYSND1Q2T9J0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TYSND1Q2T9J0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TYSND1Q2T9J0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TYSND1Q2T9J0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TYSND1Q2T9J0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TYSND1Q2T9J0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TYSND1Q2T9J0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TYSND1Q2T9J0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TYSND1Q2T9J0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TYSND1Q2T9J0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TYSND1Q2T9J0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TYSND1Q2T9J0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TYSND1Q2T9J0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TYSND1Q2T9J0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TYSND1Q2T9J0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TYSND1Q2T9J0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TYSND1Q2T9J0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TYSND1Q2T9J0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TYSND1Q2T9J0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TYSND1Q2T9J0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TYSND1Q2T9J0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TYSND1Q2T9J0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TYSND1Q2T9J0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TYSND1Q2T9J0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TYSND1Q2T9J0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TYSND1Q2T9J0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TYSND1Q2T9J0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TYSND1Q2T9J0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TYSND1Q2T9J0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TYSND1Q2T9J0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 265.1 ms