Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IMPG1Q17R60 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IMPG1Q17R60 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IMPG1Q17R60 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IMPG1Q17R60 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IMPG1Q17R60 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IMPG1Q17R60 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IMPG1Q17R60 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IMPG1Q17R60 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IMPG1Q17R60 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IMPG1Q17R60 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IMPG1Q17R60 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IMPG1Q17R60 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IMPG1Q17R60 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IMPG1Q17R60 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IMPG1Q17R60 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IMPG1Q17R60 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IMPG1Q17R60 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IMPG1Q17R60 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IMPG1Q17R60 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IMPG1Q17R60 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IMPG1Q17R60 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
IMPG1Q17R60 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IMPG1Q17R60 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IMPG1Q17R60 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IMPG1Q17R60 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IMPG1Q17R60 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IMPG1Q17R60 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IMPG1Q17R60 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IMPG1Q17R60 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IMPG1Q17R60 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IMPG1Q17R60 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IMPG1Q17R60 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IMPG1Q17R60 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IMPG1Q17R60 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IMPG1Q17R60 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IMPG1Q17R60 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IMPG1Q17R60 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IMPG1Q17R60 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IMPG1Q17R60 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IMPG1Q17R60 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IMPG1Q17R60 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IMPG1Q17R60 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IMPG1Q17R60 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IMPG1Q17R60 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IMPG1Q17R60 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IMPG1Q17R60 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IMPG1Q17R60 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IMPG1Q17R60 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IMPG1Q17R60 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IMPG1Q17R60 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IMPG1Q17R60 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IMPG1Q17R60 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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