Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBR1Q16650 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TBR1Q16650 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TBR1Q16650 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBR1Q16650 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBR1Q16650 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBR1Q16650 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TBR1Q16650 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBR1Q16650 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBR1Q16650 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBR1Q16650 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBR1Q16650 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TBR1Q16650 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBR1Q16650 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBR1Q16650 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TBR1Q16650 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBR1Q16650 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBR1Q16650 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TBR1Q16650 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBR1Q16650 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBR1Q16650 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TBR1Q16650 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TBR1Q16650 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TBR1Q16650 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TBR1Q16650 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TBR1Q16650 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TBR1Q16650 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBR1Q16650 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TBR1Q16650 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBR1Q16650 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TBR1Q16650 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBR1Q16650 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TBR1Q16650 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBR1Q16650 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBR1Q16650 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBR1Q16650 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBR1Q16650 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TBR1Q16650 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TBR1Q16650 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TBR1Q16650 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TBR1Q16650 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TBR1Q16650 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TBR1Q16650 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TBR1Q16650 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TBR1Q16650 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TBR1Q16650 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TBR1Q16650 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TBR1Q16650 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TBR1Q16650 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TBR1Q16650 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TBR1Q16650 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TBR1Q16650 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TBR1Q16650 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TBR1Q16650 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TBR1Q16650 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TBR1Q16650 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TBR1Q16650 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TBR1Q16650 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TBR1Q16650 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TBR1Q16650 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TBR1Q16650 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TBR1Q16650 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TBR1Q16650 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TBR1Q16650 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TBR1Q16650 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TBR1Q16650 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TBR1Q16650 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TBR1Q16650 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TBR1Q16650 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TBR1Q16650 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TBR1Q16650 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TBR1Q16650 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TBR1Q16650 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
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