Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMAD1Q15797 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD1Q15797 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD1Q15797 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SMAD1Q15797 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD1Q15797 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD1Q15797 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD1Q15797 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD1Q15797 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD1Q15797 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMAD1Q15797 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD1Q15797 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD1Q15797 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMAD1Q15797 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMAD1Q15797 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SMAD1Q15797 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMAD1Q15797 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMAD1Q15797 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMAD1Q15797 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SMAD1Q15797 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD1Q15797 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD1Q15797 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD1Q15797 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD1Q15797 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD1Q15797 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMAD1Q15797 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMAD1Q15797 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMAD1Q15797 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMAD1Q15797 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SMAD1Q15797 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMAD1Q15797 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMAD1Q15797 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMAD1Q15797 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMAD1Q15797 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMAD1Q15797 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMAD1Q15797 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMAD1Q15797 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMAD1Q15797 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMAD1Q15797 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SMAD1Q15797 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMAD1Q15797 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMAD1Q15797 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMAD1Q15797 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMAD1Q15797 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMAD1Q15797 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMAD1Q15797 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMAD1Q15797 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMAD1Q15797 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMAD1Q15797 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMAD1Q15797 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMAD1Q15797 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMAD1Q15797 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMAD1Q15797 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMAD1Q15797 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SMAD1Q15797 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMAD1Q15797 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMAD1Q15797 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMAD1Q15797 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMAD1Q15797 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMAD1Q15797 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMAD1Q15797 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMAD1Q15797 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMAD1Q15797 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMAD1Q15797 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
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