Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF1Q15637 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF1Q15637 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF1Q15637 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF1Q15637 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF1Q15637 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF1Q15637 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF1Q15637 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SF1Q15637 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF1Q15637 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF1Q15637 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF1Q15637 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF1Q15637 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SF1Q15637 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SF1Q15637 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SF1Q15637 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SF1Q15637 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF1Q15637 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF1Q15637 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF1Q15637 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF1Q15637 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SF1Q15637 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SF1Q15637 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF1Q15637 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF1Q15637 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SF1Q15637 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SF1Q15637 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF1Q15637 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF1Q15637 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SF1Q15637 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SF1Q15637 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF1Q15637 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF1Q15637 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF1Q15637 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF1Q15637 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF1Q15637 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SF1Q15637 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF1Q15637 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF1Q15637 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF1Q15637 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF1Q15637 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF1Q15637 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SF1Q15637 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF1Q15637 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF1Q15637 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF1Q15637 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF1Q15637 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF1Q15637 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF1Q15637 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SF1Q15637 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SF1Q15637 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SF1Q15637 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SF1Q15637 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SF1Q15637 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SF1Q15637 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SF1Q15637 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SF1Q15637 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SF1Q15637 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SF1Q15637 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SF1Q15637 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SF1Q15637 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SF1Q15637 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SF1Q15637 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SF1Q15637 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SF1Q15637 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SF1Q15637 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SF1Q15637 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SF1Q15637 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SF1Q15637 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF1Q15637 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SF1Q15637 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SF1Q15637 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SF1Q15637 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SF1Q15637 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SF1Q15637 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SF1Q15637 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SF1Q15637 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SF1Q15637 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF1Q15637 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF1Q15637 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SF1Q15637 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF1Q15637 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF1Q15637 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF1Q15637 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF1Q15637 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF1Q15637 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF1Q15637 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF1Q15637 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF1Q15637 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SF1Q15637 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF1Q15637 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SF1Q15637 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF1Q15637 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF1Q15637 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SF1Q15637 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF1Q15637 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF1Q15637 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF1Q15637 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF1Q15637 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SF1Q15637 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
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