Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TAF1CQ15572 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TAF1CQ15572 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TAF1CQ15572 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TAF1CQ15572 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TAF1CQ15572 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TAF1CQ15572 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TAF1CQ15572 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TAF1CQ15572 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TAF1CQ15572 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TAF1CQ15572 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TAF1CQ15572 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TAF1CQ15572 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TAF1CQ15572 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TAF1CQ15572 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TAF1CQ15572 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TAF1CQ15572 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TAF1CQ15572 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TAF1CQ15572 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TAF1CQ15572 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TAF1CQ15572 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TAF1CQ15572 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TAF1CQ15572 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TAF1CQ15572 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TAF1CQ15572 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TAF1CQ15572 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TAF1CQ15572 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF1CQ15572 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF1CQ15572 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF1CQ15572 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF1CQ15572 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF1CQ15572 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF1CQ15572 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF1CQ15572 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF1CQ15572 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF1CQ15572 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TAF1CQ15572 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TAF1CQ15572 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TAF1CQ15572 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TAF1CQ15572 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TAF1CQ15572 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TAF1CQ15572 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TAF1CQ15572 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TAF1CQ15572 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TAF1CQ15572 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TAF1CQ15572 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TAF1CQ15572 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TAF1CQ15572 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TAF1CQ15572 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TAF1CQ15572 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TAF1CQ15572 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TAF1CQ15572 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TAF1CQ15572 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TAF1CQ15572 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TAF1CQ15572 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TAF1CQ15572 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TAF1CQ15572 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TAF1CQ15572 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TAF1CQ15572 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TAF1CQ15572 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TAF1CQ15572 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TAF1CQ15572 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TAF1CQ15572 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TAF1CQ15572 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TAF1CQ15572 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TAF1CQ15572 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TAF1CQ15572 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TAF1CQ15572 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TAF1CQ15572 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TAF1CQ15572 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TAF1CQ15572 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TAF1CQ15572 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TAF1CQ15572 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TAF1CQ15572 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TAF1CQ15572 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TAF1CQ15572 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TAF1CQ15572 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TAF1CQ15572 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TAF1CQ15572 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF1CQ15572 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF1CQ15572 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TAF1CQ15572 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TAF1CQ15572 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TAF1CQ15572 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TAF1CQ15572 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TAF1CQ15572 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TAF1CQ15572 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TAF1CQ15572 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TAF1CQ15572 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TAF1CQ15572 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TAF1CQ15572 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TAF1CQ15572 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TAF1CQ15572 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TAF1CQ15572 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TAF1CQ15572 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TAF1CQ15572 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TAF1CQ15572 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TAF1CQ15572 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TAF1CQ15572 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TAF1CQ15572 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms