Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms