Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMED1Q13445 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMED1Q13445 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMED1Q13445 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMED1Q13445 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMED1Q13445 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMED1Q13445 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMED1Q13445 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMED1Q13445 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMED1Q13445 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMED1Q13445 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMED1Q13445 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMED1Q13445 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMED1Q13445 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMED1Q13445 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMED1Q13445 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMED1Q13445 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMED1Q13445 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMED1Q13445 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMED1Q13445 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMED1Q13445 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMED1Q13445 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMED1Q13445 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMED1Q13445 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMED1Q13445 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMED1Q13445 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMED1Q13445 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMED1Q13445 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMED1Q13445 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMED1Q13445 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMED1Q13445 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMED1Q13445 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMED1Q13445 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMED1Q13445 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMED1Q13445 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMED1Q13445 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMED1Q13445 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED1Q13445 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED1Q13445 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED1Q13445 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED1Q13445 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED1Q13445 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED1Q13445 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMED1Q13445 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMED1Q13445 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMED1Q13445 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMED1Q13445 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMED1Q13445 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMED1Q13445 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMED1Q13445 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMED1Q13445 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMED1Q13445 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMED1Q13445 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMED1Q13445 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMED1Q13445 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMED1Q13445 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMED1Q13445 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMED1Q13445 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMED1Q13445 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMED1Q13445 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMED1Q13445 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMED1Q13445 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMED1Q13445 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMED1Q13445 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMED1Q13445 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMED1Q13445 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMED1Q13445 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMED1Q13445 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMED1Q13445 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMED1Q13445 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
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