Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MSLNQ13421 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MSLNQ13421 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MSLNQ13421 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSLNQ13421 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSLNQ13421 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MSLNQ13421 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSLNQ13421 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSLNQ13421 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSLNQ13421 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSLNQ13421 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSLNQ13421 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSLNQ13421 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSLNQ13421 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSLNQ13421 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSLNQ13421 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSLNQ13421 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSLNQ13421 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSLNQ13421 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSLNQ13421 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSLNQ13421 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSLNQ13421 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSLNQ13421 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSLNQ13421 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSLNQ13421 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSLNQ13421 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSLNQ13421 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSLNQ13421 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSLNQ13421 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSLNQ13421 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSLNQ13421 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSLNQ13421 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSLNQ13421 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSLNQ13421 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSLNQ13421 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSLNQ13421 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSLNQ13421 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSLNQ13421 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSLNQ13421 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSLNQ13421 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSLNQ13421 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSLNQ13421 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSLNQ13421 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSLNQ13421 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSLNQ13421 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSLNQ13421 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSLNQ13421 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSLNQ13421 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MSLNQ13421 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MSLNQ13421 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSLNQ13421 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSLNQ13421 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MSLNQ13421 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MSLNQ13421 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSLNQ13421 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSLNQ13421 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSLNQ13421 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSLNQ13421 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MSLNQ13421 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSLNQ13421 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
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