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Protein–RNA interactions for Protein: Q12241
VAM3, Syntaxin VAM3, yeast
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283 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
VAM3
Q12241
ERO1
YML130C
1692 nt
6.78
□□□□□ -1.32
VAM3
Q12241
SER2
YGR208W
930 nt
6.78
□□□□□ -1.32
VAM3
Q12241
RCF1
YML030W
480 nt
6.78
□□□□□ -1.32
VAM3
Q12241
MRP7
YNL005C
1116 nt
6.78
□□□□□ -1.32
VAM3
Q12241
IDP3
YNL009W
1263 nt
6.78
□□□□□ -1.32
VAM3
Q12241
OLA1
YBR025C
1185 nt
6.78
□□□□□ -1.32
VAM3
Q12241
NMD5
YJR132W
3147 nt
6.78
□□□□□ -1.32
VAM3
Q12241
MET13
YGL125W
1803 nt
6.78
□□□□□ -1.32
VAM3
Q12241
DAL7
YIR031C
1665 nt
6.77
□□□□□ -1.32
VAM3
Q12241
RRT6
YGL146C
936 nt
6.77
□□□□□ -1.33
VAM3
Q12241
FAF1
YIL019W
1041 nt
6.77
□□□□□ -1.33
VAM3
Q12241
PUP1
YOR157C
786 nt
6.76
□□□□□ -1.33
VAM3
Q12241
ITR1
YDR497C
1755 nt
6.76
□□□□□ -1.33
VAM3
Q12241
HTS1
YPR033C
1641 nt
6.76
□□□□□ -1.33
VAM3
Q12241
PRC1
YMR297W
1599 nt
6.75
□□□□□ -1.33
VAM3
Q12241
YNL040W
YNL040W
1371 nt
6.75
□□□□□ -1.33
VAM3
Q12241
ASN2
YGR124W
1719 nt
6.75
□□□□□ -1.33
VAM3
Q12241
YOS9
YDR057W
1629 nt
6.75
□□□□□ -1.33
VAM3
Q12241
CIR2
YOR356W
1896 nt
6.75
□□□□□ -1.33
VAM3
Q12241
HXT9
YJL219W
1704 nt
6.73
□□□□□ -1.33
VAM3
Q12241
RSC9
YML127W
1746 nt
6.73
□□□□□ -1.33
VAM3
Q12241
SGF73
YGL066W
1974 nt
6.73
□□□□□ -1.33
VAM3
Q12241
SPE4
YLR146C
903 nt
6.73
□□□□□ -1.33
VAM3
Q12241
YER152C
YER152C
1332 nt
6.73
□□□□□ -1.33
VAM3
Q12241
YGR210C
YGR210C
1236 nt
6.72
□□□□□ -1.33
VAM3
Q12241
MET22
YOL064C
1074 nt
6.72
□□□□□ -1.33
VAM3
Q12241
ADE17
YMR120C
1779 nt
6.72
□□□□□ -1.33
VAM3
Q12241
ARO3
YDR035W
1113 nt
6.71
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
RNA170
RNA170
169 nt
6.71
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
ATO2
YNR002C
849 nt
6.71
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
ALG7
YBR243C
1347 nt
6.71
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
MAS2
YHR024C
1449 nt
6.7
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
ATP10
YLR393W
840 nt
6.7
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
YMR166C
YMR166C
1107 nt
6.7
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
OCH1
YGL038C
1443 nt
6.69
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
TOS2
YGR221C
1869 nt
6.69
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
PDC6
YGR087C
1692 nt
6.69
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
CHA1
YCL064C
1083 nt
6.69
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
YCP4
YCR004C
744 nt
6.69
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
SWM1
YDR260C
513 nt
6.69
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
CKB1
YGL019W
837 nt
6.69
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
SLG1
YOR008C
1137 nt
6.69
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
YPL108W
YPL108W
507 nt
6.69
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
SGV1
YPR161C
1974 nt
6.69
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
PRP2
YNR011C
2631 nt
6.68
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
ERG6
YML008C
1152 nt
6.68
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
HSM3
YBR272C
1443 nt
6.67
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
SAM50
YNL026W
1455 nt
6.67
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
PMT1
YDL095W
2454 nt
6.67
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
FCP1
YMR277W
2199 nt
6.67
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
TGA1
tA(UGC)A
73 nt
6.67
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
tA(UGC)E
tA(UGC)E
73 nt
6.67
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
tA(UGC)G
tA(UGC)G
73 nt
6.67
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
tA(UGC)L
tA(UGC)L
73 nt
6.67
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
tA(UGC)O
tA(UGC)O
73 nt
6.67
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
CAK1
YFL029C
1107 nt
6.67
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
RHO1
YPR165W
630 nt
6.67
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
AVL9
YLR114C
2295 nt
6.66
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
PUP3
YER094C
618 nt
6.66
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
YHL030W-A
YHL030W-A
462 nt
6.66
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
TES1
YJR019C
1050 nt
6.66
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
RRT14
YIL127C
621 nt
6.65
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
CDA1
YLR307W
906 nt
6.65
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
YTH1
YPR107C
627 nt
6.65
□□□□□ -1.34
VAM3
Q12241
SNP1
YIL061C
903 nt
6.64
□□□□□ -1.35
VAM3
Q12241
ELP6
YMR312W
822 nt
6.64
□□□□□ -1.35
VAM3
Q12241
LSP1
YPL004C
1026 nt
6.64
□□□□□ -1.35
VAM3
Q12241
ERR3
YMR323W
1314 nt
6.64
□□□□□ -1.35
VAM3
Q12241
ERR1
YOR393W
1314 nt
6.64
□□□□□ -1.35
VAM3
Q12241
ERR2
YPL281C
1314 nt
6.64
□□□□□ -1.35
VAM3
Q12241
THI73
YLR004C
1572 nt
6.64
□□□□□ -1.35
VAM3
Q12241
YIP4
YGL198W
708 nt
6.63
□□□□□ -1.35
VAM3
Q12241
PEX28
YHR150W
1740 nt
6.63
□□□□□ -1.35
VAM3
Q12241
YMR007W
YMR007W
381 nt
6.63
□□□□□ -1.35
VAM3
Q12241
YOR300W
YOR300W
309 nt
6.63
□□□□□ -1.35
VAM3
Q12241
PDC5
YLR134W
1692 nt
6.62
□□□□□ -1.35
VAM3
Q12241
MTC6
YHR151C
1581 nt
6.62
□□□□□ -1.35
VAM3
Q12241
RMA1
YKL132C
1293 nt
6.62
□□□□□ -1.35
VAM3
Q12241
YLR030W
YLR030W
792 nt
6.62
□□□□□ -1.35
VAM3
Q12241
FCY1
YPR062W
477 nt
6.62
□□□□□ -1.35
VAM3
Q12241
RUP1
YOR138C
2016 nt
6.62
□□□□□ -1.35
VAM3
Q12241
HXT8
YJL214W
1710 nt
6.62
□□□□□ -1.35
VAM3
Q12241
YMR253C
YMR253C
1245 nt
6.61
□□□□□ -1.35
VAM3
Q12241
TPO1
YLL028W
1761 nt
6.61
□□□□□ -1.35
VAM3
Q12241
ACO1
YLR304C
2337 nt
6.61
□□□□□ -1.35
VAM3
Q12241
KDX1
YKL161C
1302 nt
6.59
□□□□□ -1.35
VAM3
Q12241
YPT31
YER031C
672 nt
6.59
□□□□□ -1.35
VAM3
Q12241
RCR1
YBR005W
642 nt
6.59
□□□□□ -1.35
VAM3
Q12241
SHC1
YER096W
1539 nt
6.59
□□□□□ -1.35
VAM3
Q12241
GNA1
YFL017C
480 nt
6.58
□□□□□ -1.36
VAM3
Q12241
PRE10
YOR362C
867 nt
6.58
□□□□□ -1.36
VAM3
Q12241
MAL31
YBR298C
1845 nt
6.57
□□□□□ -1.36
VAM3
Q12241
MAK32
YCR019W
1092 nt
6.57
□□□□□ -1.36
VAM3
Q12241
YER152W-A
YER152W-A
567 nt
6.57
□□□□□ -1.36
VAM3
Q12241
YJL160C
YJL160C
864 nt
6.57
□□□□□ -1.36
VAM3
Q12241
YPL277C
YPL277C
1464 nt
6.57
□□□□□ -1.36
VAM3
Q12241
BIM1
YER016W
1035 nt
6.56
□□□□□ -1.36
VAM3
Q12241
YER156C
YER156C
1017 nt
6.56
□□□□□ -1.36
VAM3
Q12241
YHC3
YJL059W
1227 nt
6.56
□□□□□ -1.36
VAM3
Q12241
RCF2
YNR018W
675 nt
6.56
□□□□□ -1.36
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