Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

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Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 YHR177WYHR177W 1362 nt10.11□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 TCA17YEL048C 459 nt10.1□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 TOA2YKL058W 369 nt10.1□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 MTR2YKL186C 555 nt10.1□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 RCL1YOL010W 1104 nt10.1□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 UFD1YGR048W 1086 nt10.09□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 PTC4YBR125C 1182 nt10.09□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 GND2YGR256W 1479 nt10.09□□□□□ -0.79
NCR1Q12200 TVP23YDR084C 600 nt10.08□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 YNL226WYNL226W 411 nt10.08□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 YBR027CYBR027C 333 nt10.08□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 GAL3YDR009W 1563 nt10.08□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 SSN3YPL042C 1668 nt10.07□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 VBA3YCL069W 1377 nt10.07□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 CAB1YDR531W 1104 nt10.07□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt10.07□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 SSP2YOR242C 1116 nt10.07□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 PRE2YPR103W 864 nt10.07□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 BNI5YNL166C 1347 nt10.07□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 KAR1YNL188W 1302 nt10.07□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 ISR1YPR106W 1332 nt10.07□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 ALG7YBR243C 1347 nt10.07□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 CCT5YJR064W 1689 nt10.06□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 EEB1YPL095C 1371 nt10.06□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 SRG1SRG1 551 nt10.06□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 YGR016WYGR016W 573 nt10.06□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 DAM1YGR113W 1032 nt10.06□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 PCT1YGR202C 1275 nt10.06□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.06□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 DBR1YKL149C 1218 nt10.06□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 YLR271WYLR271W 825 nt10.06□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 CSM3YMR048W 954 nt10.06□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 PBP1YGR178C 2169 nt10.06□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt10.06□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt10.06□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 PHO23YNL097C 993 nt10.05□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 YKL091CYKL091C 933 nt10.04□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 PBP2YBR233W 1242 nt10.04□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 MSC1YML128C 1542 nt10.03□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 EDC1YGL222C 528 nt10.03□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 SDS3YIL084C 984 nt10.03□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 OAC1YKL120W 975 nt10.03□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 DYN3YMR299C 939 nt10.03□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 SEC12YNR026C 1416 nt10.03□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 KDX1YKL161C 1302 nt10.03□□□□□ -0.8
NCR1Q12200 HTB1YDR224C 396 nt10.02□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 OKP1YGR179C 1221 nt10.02□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 DCD1YHR144C 939 nt10.02□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 LNP1YHR192W 837 nt10.02□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 SRP21YKL122C 504 nt10.02□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 SPE4YLR146C 903 nt10.02□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt10.02□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 RRP36YOR287C 903 nt10.02□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 MDM10YAL010C 1482 nt10.02□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 YDL027CYDL027C 1263 nt10.01□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 URA6YKL024C 615 nt10.01□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt10.01□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 SNZ1YMR096W 894 nt10.01□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 IPI1YHR085W 1005 nt10□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 ADE1YAR015W 921 nt10□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 CCL1YPR025C 1182 nt10□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 SUI2YJR007W 915 nt9.99□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 YKL202WYKL202W 582 nt9.99□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 CLP1YOR250C 1338 nt9.99□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.98□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 VMA6YLR447C 1038 nt9.98□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 RPT5YOR117W 1305 nt9.98□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 OXA1YER154W 1209 nt9.97□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 REV7YIL139C 738 nt9.97□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 YJL211CYJL211C 444 nt9.97□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 CYT2YKL087C 675 nt9.97□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 OYE3YPL171C 1203 nt9.97□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 LSB5YCL034W 1065 nt9.97□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 FLR1YBR008C 1647 nt9.96□□□□□ -0.81
NCR1Q12200 FUB1YCR076C 753 nt9.96□□□□□ -0.82
NCR1Q12200 UPF3YGR072W 1164 nt9.96□□□□□ -0.82
NCR1Q12200 CDC8YJR057W 651 nt9.96□□□□□ -0.82
NCR1Q12200 RRI1YDL216C 1323 nt9.96□□□□□ -0.82
NCR1Q12200 CKA1YIL035C 1119 nt9.95□□□□□ -0.82
NCR1Q12200 YLR460CYLR460C 1131 nt9.95□□□□□ -0.82
NCR1Q12200 YBR232CYBR232C 360 nt9.95□□□□□ -0.82
NCR1Q12200 ZRT3YKL175W 1512 nt9.95□□□□□ -0.82
NCR1Q12200 KTR7YIL085C 1554 nt9.95□□□□□ -0.82
NCR1Q12200 SEC61YLR378C 1443 nt9.94□□□□□ -0.82
NCR1Q12200 YDL016CYDL016C 303 nt9.94□□□□□ -0.82
NCR1Q12200 YKR051WYKR051W 1257 nt9.94□□□□□ -0.82
NCR1Q12200 YIP3YNL044W 531 nt9.94□□□□□ -0.82
NCR1Q12200 YNL174WYNL174W 573 nt9.94□□□□□ -0.82
NCR1Q12200 GPM3YOL056W 912 nt9.94□□□□□ -0.82
NCR1Q12200 PEF1YGR058W 1008 nt9.93□□□□□ -0.82
NCR1Q12200 ELO1YJL196C 933 nt9.93□□□□□ -0.82
NCR1Q12200 YLR379WYLR379W 375 nt9.93□□□□□ -0.82
NCR1Q12200 FYV6YNL133C 522 nt9.93□□□□□ -0.82
NCR1Q12200 USV1YPL230W 1176 nt9.93□□□□□ -0.82
NCR1Q12200 TEP1YNL128W 1305 nt9.92□□□□□ -0.82
NCR1Q12200 MRPL32YCR003W 552 nt9.92□□□□□ -0.82
NCR1Q12200 PAU5YFL020C 369 nt9.92□□□□□ -0.82
NCR1Q12200 YJL067WYJL067W 351 nt9.92□□□□□ -0.82
NCR1Q12200 YBR089WYBR089W 600 nt9.92□□□□□ -0.82
NCR1Q12200 TPS1YBR126C 1488 nt9.91□□□□□ -0.82
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