Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBBP4Q09028 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RBBP4Q09028 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RBBP4Q09028 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
RBBP4Q09028 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RBBP4Q09028 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RBBP4Q09028 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP4Q09028 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP4Q09028 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP4Q09028 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RBBP4Q09028 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBBP4Q09028 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBBP4Q09028 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBBP4Q09028 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RBBP4Q09028 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBBP4Q09028 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBBP4Q09028 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RBBP4Q09028 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RBBP4Q09028 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP4Q09028 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP4Q09028 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP4Q09028 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP4Q09028 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP4Q09028 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP4Q09028 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP4Q09028 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP4Q09028 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP4Q09028 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBBP4Q09028 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBBP4Q09028 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBBP4Q09028 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBBP4Q09028 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RBBP4Q09028 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RBBP4Q09028 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBBP4Q09028 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RBBP4Q09028 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP4Q09028 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP4Q09028 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP4Q09028 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP4Q09028 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP4Q09028 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP4Q09028 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP4Q09028 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP4Q09028 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBBP4Q09028 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBBP4Q09028 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBBP4Q09028 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBBP4Q09028 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBBP4Q09028 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RBBP4Q09028 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP4Q09028 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP4Q09028 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RBBP4Q09028 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBBP4Q09028 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBBP4Q09028 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBBP4Q09028 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBBP4Q09028 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RBBP4Q09028 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBBP4Q09028 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms