Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNP2Q05952 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNP2Q05952 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNP2Q05952 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNP2Q05952 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNP2Q05952 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNP2Q05952 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNP2Q05952 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNP2Q05952 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNP2Q05952 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNP2Q05952 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNP2Q05952 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNP2Q05952 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNP2Q05952 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNP2Q05952 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNP2Q05952 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNP2Q05952 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNP2Q05952 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNP2Q05952 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TNP2Q05952 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNP2Q05952 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TNP2Q05952 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TNP2Q05952 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms