Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLOD1Q02809 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLOD1Q02809 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLOD1Q02809 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLOD1Q02809 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLOD1Q02809 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLOD1Q02809 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLOD1Q02809 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLOD1Q02809 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLOD1Q02809 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLOD1Q02809 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLOD1Q02809 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PLOD1Q02809 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PLOD1Q02809 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PLOD1Q02809 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms