Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RUNX1Q01196 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RUNX1Q01196 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX1Q01196 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX1Q01196 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX1Q01196 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX1Q01196 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX1Q01196 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX1Q01196 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX1Q01196 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX1Q01196 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX1Q01196 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms