Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FGD1P98174 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FGD1P98174 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
FGD1P98174 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FGD1P98174 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FGD1P98174 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FGD1P98174 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FGD1P98174 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FGD1P98174 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FGD1P98174 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FGD1P98174 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
FGD1P98174 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FGD1P98174 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FGD1P98174 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FGD1P98174 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FGD1P98174 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FGD1P98174 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FGD1P98174 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FGD1P98174 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.41
FGD1P98174 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FGD1P98174 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FGD1P98174 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FGD1P98174 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FGD1P98174 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FGD1P98174 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FGD1P98174 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FGD1P98174 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FGD1P98174 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FGD1P98174 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FGD1P98174 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FGD1P98174 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FGD1P98174 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FGD1P98174 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FGD1P98174 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FGD1P98174 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FGD1P98174 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FGD1P98174 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FGD1P98174 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
FGD1P98174 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FGD1P98174 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FGD1P98174 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FGD1P98174 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FGD1P98174 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FGD1P98174 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FGD1P98174 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FGD1P98174 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FGD1P98174 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FGD1P98174 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FGD1P98174 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FGD1P98174 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FGD1P98174 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FGD1P98174 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
FGD1P98174 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FGD1P98174 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FGD1P98174 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FGD1P98174 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FGD1P98174 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FGD1P98174 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FGD1P98174 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FGD1P98174 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FGD1P98174 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
FGD1P98174 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
FGD1P98174 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
FGD1P98174 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
FGD1P98174 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FGD1P98174 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FGD1P98174 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FGD1P98174 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FGD1P98174 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FGD1P98174 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FGD1P98174 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FGD1P98174 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FGD1P98174 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FGD1P98174 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FGD1P98174 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FGD1P98174 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FGD1P98174 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FGD1P98174 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
FGD1P98174 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FGD1P98174 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FGD1P98174 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FGD1P98174 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FGD1P98174 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FGD1P98174 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FGD1P98174 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FGD1P98174 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FGD1P98174 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FGD1P98174 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FGD1P98174 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FGD1P98174 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FGD1P98174 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
FGD1P98174 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FGD1P98174 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FGD1P98174 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
FGD1P98174 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FGD1P98174 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FGD1P98174 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FGD1P98174 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FGD1P98174 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FGD1P98174 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms