Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GPC5P78333 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GPC5P78333 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GPC5P78333 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GPC5P78333 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GPC5P78333 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GPC5P78333 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GPC5P78333 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GPC5P78333 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPC5P78333 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPC5P78333 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPC5P78333 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPC5P78333 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPC5P78333 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPC5P78333 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPC5P78333 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPC5P78333 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPC5P78333 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPC5P78333 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPC5P78333 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPC5P78333 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPC5P78333 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPC5P78333 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPC5P78333 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPC5P78333 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPC5P78333 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPC5P78333 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPC5P78333 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPC5P78333 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPC5P78333 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPC5P78333 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPC5P78333 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPC5P78333 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPC5P78333 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPC5P78333 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPC5P78333 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPC5P78333 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPC5P78333 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPC5P78333 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPC5P78333 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPC5P78333 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPC5P78333 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPC5P78333 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPC5P78333 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPC5P78333 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPC5P78333 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPC5P78333 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPC5P78333 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPC5P78333 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPC5P78333 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPC5P78333 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPC5P78333 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPC5P78333 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPC5P78333 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPC5P78333 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPC5P78333 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPC5P78333 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPC5P78333 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPC5P78333 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPC5P78333 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPC5P78333 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPC5P78333 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPC5P78333 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPC5P78333 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPC5P78333 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPC5P78333 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPC5P78333 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPC5P78333 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPC5P78333 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPC5P78333 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPC5P78333 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPC5P78333 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPC5P78333 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPC5P78333 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPC5P78333 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPC5P78333 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPC5P78333 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPC5P78333 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPC5P78333 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPC5P78333 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPC5P78333 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPC5P78333 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPC5P78333 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPC5P78333 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPC5P78333 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPC5P78333 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPC5P78333 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPC5P78333 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPC5P78333 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GPC5P78333 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GPC5P78333 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GPC5P78333 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GPC5P78333 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GPC5P78333 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPC5P78333 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPC5P78333 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPC5P78333 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPC5P78333 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPC5P78333 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GPC5P78333 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms