Protein–RNA interactions for Protein: P67809

YBX1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1P67809 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
YBX1P67809 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
YBX1P67809 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YBX1P67809 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YBX1P67809 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
YBX1P67809 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
YBX1P67809 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YBX1P67809 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YBX1P67809 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YBX1P67809 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
YBX1P67809 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
YBX1P67809 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
YBX1P67809 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YBX1P67809 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YBX1P67809 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
YBX1P67809 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
YBX1P67809 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
YBX1P67809 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
YBX1P67809 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YBX1P67809 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
YBX1P67809 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YBX1P67809 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YBX1P67809 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YBX1P67809 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YBX1P67809 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YBX1P67809 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
YBX1P67809 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YBX1P67809 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YBX1P67809 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YBX1P67809 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YBX1P67809 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YBX1P67809 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YBX1P67809 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YBX1P67809 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YBX1P67809 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YBX1P67809 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YBX1P67809 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YBX1P67809 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
YBX1P67809 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
YBX1P67809 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YBX1P67809 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
YBX1P67809 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
YBX1P67809 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
YBX1P67809 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YBX1P67809 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YBX1P67809 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YBX1P67809 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YBX1P67809 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YBX1P67809 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YBX1P67809 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YBX1P67809 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YBX1P67809 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YBX1P67809 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YBX1P67809 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YBX1P67809 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YBX1P67809 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
YBX1P67809 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YBX1P67809 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YBX1P67809 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YBX1P67809 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YBX1P67809 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YBX1P67809 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YBX1P67809 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YBX1P67809 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YBX1P67809 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YBX1P67809 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YBX1P67809 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YBX1P67809 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YBX1P67809 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
YBX1P67809 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YBX1P67809 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YBX1P67809 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
YBX1P67809 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
YBX1P67809 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
YBX1P67809 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
YBX1P67809 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
YBX1P67809 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
YBX1P67809 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
YBX1P67809 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
YBX1P67809 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
YBX1P67809 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YBX1P67809 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YBX1P67809 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YBX1P67809 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YBX1P67809 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
YBX1P67809 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YBX1P67809 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YBX1P67809 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YBX1P67809 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
YBX1P67809 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
YBX1P67809 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
YBX1P67809 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
YBX1P67809 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
YBX1P67809 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
YBX1P67809 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
YBX1P67809 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
YBX1P67809 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
YBX1P67809 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YBX1P67809 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
YBX1P67809 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.6 ms