Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCALDP61601 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCALDP61601 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCALDP61601 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCALDP61601 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCALDP61601 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCALDP61601 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCALDP61601 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCALDP61601 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCALDP61601 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCALDP61601 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCALDP61601 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCALDP61601 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCALDP61601 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCALDP61601 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCALDP61601 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCALDP61601 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCALDP61601 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCALDP61601 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCALDP61601 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCALDP61601 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCALDP61601 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCALDP61601 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCALDP61601 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCALDP61601 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCALDP61601 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NCALDP61601 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCALDP61601 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCALDP61601 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCALDP61601 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCALDP61601 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCALDP61601 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCALDP61601 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCALDP61601 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCALDP61601 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCALDP61601 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCALDP61601 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCALDP61601 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCALDP61601 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCALDP61601 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCALDP61601 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCALDP61601 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NCALDP61601 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCALDP61601 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCALDP61601 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCALDP61601 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCALDP61601 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCALDP61601 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCALDP61601 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCALDP61601 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCALDP61601 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCALDP61601 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCALDP61601 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCALDP61601 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCALDP61601 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCALDP61601 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCALDP61601 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCALDP61601 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCALDP61601 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCALDP61601 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCALDP61601 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NCALDP61601 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCALDP61601 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCALDP61601 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCALDP61601 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCALDP61601 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCALDP61601 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCALDP61601 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCALDP61601 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCALDP61601 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCALDP61601 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCALDP61601 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCALDP61601 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCALDP61601 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCALDP61601 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCALDP61601 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCALDP61601 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCALDP61601 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCALDP61601 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCALDP61601 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCALDP61601 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCALDP61601 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCALDP61601 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCALDP61601 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCALDP61601 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCALDP61601 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCALDP61601 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCALDP61601 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCALDP61601 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCALDP61601 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCALDP61601 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCALDP61601 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCALDP61601 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCALDP61601 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCALDP61601 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCALDP61601 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCALDP61601 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCALDP61601 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCALDP61601 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCALDP61601 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms