Protein–RNA interactions for Protein: P61224

RAP1B, Ras-related protein Rap-1b, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1BP61224 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAP1BP61224 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAP1BP61224 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAP1BP61224 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAP1BP61224 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAP1BP61224 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAP1BP61224 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAP1BP61224 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAP1BP61224 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAP1BP61224 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAP1BP61224 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAP1BP61224 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAP1BP61224 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAP1BP61224 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAP1BP61224 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAP1BP61224 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAP1BP61224 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAP1BP61224 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAP1BP61224 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAP1BP61224 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAP1BP61224 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAP1BP61224 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAP1BP61224 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAP1BP61224 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAP1BP61224 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAP1BP61224 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAP1BP61224 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAP1BP61224 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAP1BP61224 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAP1BP61224 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAP1BP61224 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAP1BP61224 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAP1BP61224 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAP1BP61224 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAP1BP61224 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAP1BP61224 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAP1BP61224 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAP1BP61224 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAP1BP61224 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAP1BP61224 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAP1BP61224 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAP1BP61224 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAP1BP61224 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms