Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTR3P61158 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACTR3P61158 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTR3P61158 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTR3P61158 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTR3P61158 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ACTR3P61158 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTR3P61158 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTR3P61158 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTR3P61158 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTR3P61158 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACTR3P61158 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTR3P61158 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTR3P61158 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTR3P61158 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACTR3P61158 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACTR3P61158 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ACTR3P61158 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACTR3P61158 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTR3P61158 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTR3P61158 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACTR3P61158 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTR3P61158 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTR3P61158 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTR3P61158 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTR3P61158 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTR3P61158 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTR3P61158 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACTR3P61158 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTR3P61158 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTR3P61158 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTR3P61158 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACTR3P61158 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTR3P61158 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTR3P61158 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACTR3P61158 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACTR3P61158 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACTR3P61158 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms