Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELLP55199 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELLP55199 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ELLP55199 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ELLP55199 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELLP55199 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELLP55199 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELLP55199 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELLP55199 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELLP55199 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELLP55199 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ELLP55199 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELLP55199 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELLP55199 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELLP55199 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELLP55199 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELLP55199 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ELLP55199 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ELLP55199 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ELLP55199 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ELLP55199 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ELLP55199 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ELLP55199 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELLP55199 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELLP55199 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELLP55199 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELLP55199 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELLP55199 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELLP55199 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ELLP55199 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELLP55199 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELLP55199 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELLP55199 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ELLP55199 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELLP55199 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELLP55199 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELLP55199 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELLP55199 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELLP55199 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELLP55199 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ELLP55199 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELLP55199 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELLP55199 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELLP55199 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ELLP55199 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELLP55199 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELLP55199 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ELLP55199 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ELLP55199 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELLP55199 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELLP55199 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELLP55199 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ELLP55199 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELLP55199 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELLP55199 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELLP55199 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELLP55199 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ELLP55199 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ELLP55199 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ELLP55199 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELLP55199 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELLP55199 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELLP55199 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELLP55199 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELLP55199 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELLP55199 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELLP55199 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELLP55199 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELLP55199 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELLP55199 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELLP55199 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELLP55199 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ELLP55199 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELLP55199 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELLP55199 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELLP55199 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELLP55199 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELLP55199 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELLP55199 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELLP55199 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELLP55199 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELLP55199 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELLP55199 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELLP55199 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELLP55199 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELLP55199 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELLP55199 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELLP55199 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ELLP55199 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELLP55199 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELLP55199 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELLP55199 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELLP55199 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ELLP55199 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELLP55199 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELLP55199 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELLP55199 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELLP55199 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ELLP55199 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ELLP55199 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms