Protein–RNA interactions for Protein: P52907

CAPZA1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA1P52907 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA1P52907 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA1P52907 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CAPZA1P52907 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CAPZA1P52907 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZA1P52907 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZA1P52907 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CAPZA1P52907 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CAPZA1P52907 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA1P52907 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA1P52907 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA1P52907 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA1P52907 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA1P52907 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA1P52907 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA1P52907 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CAPZA1P52907 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.7 ms