Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE6CP51160 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE6CP51160 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE6CP51160 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE6CP51160 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE6CP51160 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE6CP51160 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE6CP51160 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE6CP51160 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE6CP51160 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE6CP51160 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE6CP51160 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE6CP51160 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE6CP51160 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE6CP51160 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE6CP51160 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE6CP51160 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE6CP51160 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE6CP51160 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE6CP51160 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE6CP51160 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE6CP51160 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDE6CP51160 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE6CP51160 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE6CP51160 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE6CP51160 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE6CP51160 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE6CP51160 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE6CP51160 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE6CP51160 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE6CP51160 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE6CP51160 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE6CP51160 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE6CP51160 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE6CP51160 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms