Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CENPFP49454 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CENPFP49454 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CENPFP49454 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CENPFP49454 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CENPFP49454 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPFP49454 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CENPFP49454 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPFP49454 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPFP49454 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPFP49454 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CENPFP49454 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPFP49454 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CENPFP49454 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CENPFP49454 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
CENPFP49454 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CENPFP49454 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CENPFP49454 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CENPFP49454 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CENPFP49454 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CENPFP49454 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CENPFP49454 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CENPFP49454 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CENPFP49454 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CENPFP49454 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CENPFP49454 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CENPFP49454 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CENPFP49454 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CENPFP49454 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CENPFP49454 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CENPFP49454 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CENPFP49454 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CENPFP49454 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CENPFP49454 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CENPFP49454 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CENPFP49454 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CENPFP49454 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CENPFP49454 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CENPFP49454 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CENPFP49454 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CENPFP49454 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CENPFP49454 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPFP49454 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPFP49454 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CENPFP49454 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPFP49454 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPFP49454 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPFP49454 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CENPFP49454 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPFP49454 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPFP49454 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CENPFP49454 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPFP49454 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPFP49454 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPFP49454 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPFP49454 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPFP49454 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CENPFP49454 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CENPFP49454 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CENPFP49454 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CENPFP49454 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
CENPFP49454 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CENPFP49454 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CENPFP49454 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CENPFP49454 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPFP49454 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPFP49454 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CENPFP49454 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPFP49454 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPFP49454 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPFP49454 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CENPFP49454 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CENPFP49454 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CENPFP49454 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CENPFP49454 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CENPFP49454 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CENPFP49454 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CENPFP49454 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPFP49454 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CENPFP49454 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CENPFP49454 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPFP49454 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPFP49454 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPFP49454 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPFP49454 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPFP49454 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPFP49454 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPFP49454 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPFP49454 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPFP49454 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPFP49454 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPFP49454 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPFP49454 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPFP49454 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPFP49454 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPFP49454 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPFP49454 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPFP49454 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CENPFP49454 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPFP49454 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms