Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC9A3P48764 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A3P48764 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A3P48764 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A3P48764 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A3P48764 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A3P48764 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A3P48764 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC9A3P48764 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A3P48764 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC9A3P48764 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A3P48764 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A3P48764 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC9A3P48764 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A3P48764 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A3P48764 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC9A3P48764 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A3P48764 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A3P48764 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC9A3P48764 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A3P48764 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A3P48764 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A3P48764 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9A3P48764 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9A3P48764 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A3P48764 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A3P48764 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A3P48764 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A3P48764 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A3P48764 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9A3P48764 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A3P48764 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A3P48764 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A3P48764 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A3P48764 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A3P48764 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9A3P48764 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A3P48764 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A3P48764 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A3P48764 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9A3P48764 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A3P48764 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A3P48764 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A3P48764 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9A3P48764 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A3P48764 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC9A3P48764 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms