Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT6CP48668 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT6CP48668 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT6CP48668 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT6CP48668 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT6CP48668 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT6CP48668 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT6CP48668 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT6CP48668 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT6CP48668 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT6CP48668 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT6CP48668 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT6CP48668 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT6CP48668 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT6CP48668 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT6CP48668 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT6CP48668 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT6CP48668 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT6CP48668 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT6CP48668 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT6CP48668 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT6CP48668 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT6CP48668 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT6CP48668 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT6CP48668 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT6CP48668 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT6CP48668 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT6CP48668 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT6CP48668 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT6CP48668 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT6CP48668 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT6CP48668 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT6CP48668 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT6CP48668 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT6CP48668 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT6CP48668 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT6CP48668 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT6CP48668 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT6CP48668 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT6CP48668 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT6CP48668 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT6CP48668 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT6CP48668 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT6CP48668 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT6CP48668 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT6CP48668 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT6CP48668 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT6CP48668 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT6CP48668 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT6CP48668 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT6CP48668 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT6CP48668 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT6CP48668 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT6CP48668 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT6CP48668 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT6CP48668 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT6CP48668 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT6CP48668 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT6CP48668 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT6CP48668 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT6CP48668 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT6CP48668 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT6CP48668 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT6CP48668 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms