Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MAGEA4P43358 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MAGEA4P43358 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAGEA4P43358 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MAGEA4P43358 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAGEA4P43358 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MAGEA4P43358 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAGEA4P43358 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MAGEA4P43358 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MAGEA4P43358 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MAGEA4P43358 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MAGEA4P43358 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MAGEA4P43358 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MAGEA4P43358 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MAGEA4P43358 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MAGEA4P43358 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MAGEA4P43358 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MAGEA4P43358 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MAGEA4P43358 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MAGEA4P43358 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MAGEA4P43358 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MAGEA4P43358 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MAGEA4P43358 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MAGEA4P43358 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MAGEA4P43358 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MAGEA4P43358 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MAGEA4P43358 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MAGEA4P43358 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MAGEA4P43358 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MAGEA4P43358 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MAGEA4P43358 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MAGEA4P43358 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MAGEA4P43358 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MAGEA4P43358 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MAGEA4P43358 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MAGEA4P43358 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MAGEA4P43358 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MAGEA4P43358 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAGEA4P43358 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAGEA4P43358 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MAGEA4P43358 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAGEA4P43358 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAGEA4P43358 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MAGEA4P43358 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAGEA4P43358 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MAGEA4P43358 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAGEA4P43358 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAGEA4P43358 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAGEA4P43358 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MAGEA4P43358 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAGEA4P43358 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAGEA4P43358 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAGEA4P43358 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAGEA4P43358 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAGEA4P43358 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAGEA4P43358 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAGEA4P43358 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAGEA4P43358 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAGEA4P43358 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAGEA4P43358 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAGEA4P43358 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MAGEA4P43358 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAGEA4P43358 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAGEA4P43358 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms