Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAGEA1P43355 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MAGEA1P43355 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MAGEA1P43355 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MAGEA1P43355 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MAGEA1P43355 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MAGEA1P43355 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MAGEA1P43355 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAGEA1P43355 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAGEA1P43355 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAGEA1P43355 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MAGEA1P43355 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAGEA1P43355 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MAGEA1P43355 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAGEA1P43355 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAGEA1P43355 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAGEA1P43355 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAGEA1P43355 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEA1P43355 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEA1P43355 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEA1P43355 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEA1P43355 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEA1P43355 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEA1P43355 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEA1P43355 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAGEA1P43355 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAGEA1P43355 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAGEA1P43355 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAGEA1P43355 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAGEA1P43355 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MAGEA1P43355 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAGEA1P43355 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAGEA1P43355 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MAGEA1P43355 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAGEA1P43355 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAGEA1P43355 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MAGEA1P43355 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAGEA1P43355 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAGEA1P43355 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MAGEA1P43355 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
MAGEA1P43355 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEA1P43355 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEA1P43355 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEA1P43355 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEA1P43355 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MAGEA1P43355 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAGEA1P43355 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAGEA1P43355 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAGEA1P43355 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MAGEA1P43355 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MAGEA1P43355 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MAGEA1P43355 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MAGEA1P43355 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms