Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACAA2P42765 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACAA2P42765 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACAA2P42765 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACAA2P42765 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACAA2P42765 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACAA2P42765 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACAA2P42765 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACAA2P42765 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACAA2P42765 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACAA2P42765 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACAA2P42765 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACAA2P42765 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACAA2P42765 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACAA2P42765 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACAA2P42765 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACAA2P42765 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ACAA2P42765 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ACAA2P42765 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACAA2P42765 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACAA2P42765 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACAA2P42765 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACAA2P42765 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACAA2P42765 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACAA2P42765 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACAA2P42765 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACAA2P42765 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACAA2P42765 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACAA2P42765 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACAA2P42765 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACAA2P42765 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACAA2P42765 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACAA2P42765 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACAA2P42765 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACAA2P42765 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACAA2P42765 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACAA2P42765 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACAA2P42765 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACAA2P42765 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACAA2P42765 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACAA2P42765 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACAA2P42765 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACAA2P42765 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms