Protein–RNA interactions for Protein: P32971

TNFSF8, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF8P32971 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFSF8P32971 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF8P32971 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF8P32971 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF8P32971 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFSF8P32971 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF8P32971 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFSF8P32971 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF8P32971 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFSF8P32971 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF8P32971 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF8P32971 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF8P32971 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFSF8P32971 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF8P32971 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF8P32971 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF8P32971 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF8P32971 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TNFSF8P32971 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNFSF8P32971 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNFSF8P32971 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNFSF8P32971 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF8P32971 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF8P32971 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF8P32971 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNFSF8P32971 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF8P32971 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF8P32971 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF8P32971 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF8P32971 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNFSF8P32971 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF8P32971 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNFSF8P32971 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNFSF8P32971 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF8P32971 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNFSF8P32971 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF8P32971 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF8P32971 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF8P32971 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF8P32971 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNFSF8P32971 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF8P32971 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF8P32971 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF8P32971 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF8P32971 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF8P32971 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNFSF8P32971 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNFSF8P32971 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF8P32971 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF8P32971 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFSF8P32971 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF8P32971 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF8P32971 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFSF8P32971 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 292.8 ms