Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHC1P29353 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHC1P29353 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHC1P29353 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHC1P29353 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHC1P29353 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHC1P29353 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHC1P29353 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHC1P29353 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHC1P29353 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHC1P29353 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHC1P29353 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHC1P29353 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SHC1P29353 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHC1P29353 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHC1P29353 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHC1P29353 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHC1P29353 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHC1P29353 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SHC1P29353 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SHC1P29353 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SHC1P29353 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SHC1P29353 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SHC1P29353 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHC1P29353 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SHC1P29353 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHC1P29353 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHC1P29353 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SHC1P29353 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SHC1P29353 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHC1P29353 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHC1P29353 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SHC1P29353 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHC1P29353 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHC1P29353 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SHC1P29353 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHC1P29353 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHC1P29353 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHC1P29353 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHC1P29353 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHC1P29353 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHC1P29353 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHC1P29353 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHC1P29353 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHC1P29353 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHC1P29353 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHC1P29353 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHC1P29353 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHC1P29353 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHC1P29353 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHC1P29353 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHC1P29353 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHC1P29353 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHC1P29353 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SHC1P29353 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHC1P29353 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHC1P29353 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHC1P29353 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHC1P29353 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHC1P29353 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHC1P29353 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHC1P29353 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHC1P29353 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHC1P29353 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHC1P29353 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHC1P29353 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHC1P29353 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHC1P29353 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHC1P29353 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHC1P29353 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHC1P29353 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHC1P29353 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHC1P29353 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHC1P29353 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHC1P29353 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SHC1P29353 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SHC1P29353 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SHC1P29353 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SHC1P29353 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SHC1P29353 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SHC1P29353 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SHC1P29353 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SHC1P29353 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SHC1P29353 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHC1P29353 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHC1P29353 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SHC1P29353 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHC1P29353 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHC1P29353 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHC1P29353 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHC1P29353 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHC1P29353 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHC1P29353 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHC1P29353 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SHC1P29353 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHC1P29353 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHC1P29353 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHC1P29353 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHC1P29353 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHC1P29353 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms